先睹為快：新一代植物廣靶定量代謝技術
本次發(fā)布的植物廣靶定量代謝組學產品并非簡單技術迭代，百譜生物研發(fā)經理李天運在發(fā)布會中詳細介紹了該產品是針對植物研究領域長期存在的檢測靈敏度不足、數(shù)據(jù)庫不全、缺少內標定量三大痛點，形成多維度解決方案，獲與會專家高度認可。
高靈敏檢測：突破微量代謝物局限
針對傳統(tǒng)技術難以捕捉植物抗逆、品質形成過程中微量代謝物的痛點，該產品采用 AB SCIEX QTRAP7500 高靈敏度檢測平臺，將檢測限降低一個數(shù)量級，可精準定量低豐度植物代謝物、特殊滲透調節(jié)物質等低含量成分。即使是植物應對脅迫時微量積累的關鍵代謝物，也能被清晰捕捉。
數(shù)據(jù)庫完整性：高達7萬種代謝物
代謝組研究的核心在于數(shù)據(jù)庫完整性，該產品將代謝物數(shù)據(jù)庫從傳統(tǒng) “數(shù)千種” 擴容至 “數(shù)萬種”，高達7萬種，并補充標準品多維注釋信息，使代謝物鑒定準確率大幅提升，可有效避免 “漏檢關鍵成分”“誤判物質種類” 等問題。
業(yè)內首發(fā)：同位素內標定量
業(yè)內首次在植物廣靶技術上加入同位素內標進行定量分析平臺，擁有多種內標選擇，能根據(jù)不同的檢測需求和化合物特性，靈活挑選合適的內標，通過基質內標線性和自研算法校正，可以得到更為準確的定量結果。
SCIEX中國市場開發(fā)經理方晶晶深度解讀了QTRAP7500設備技術的革新和優(yōu)勢，他認為：“代謝物的高通量、高靈敏和大隊列穩(wěn)定性是未來代謝組發(fā)展的重要方向”。
企業(yè)戰(zhàn)略布局：推動代謝組技術從實驗室走向田間
發(fā)布會上，百邁客生物創(chuàng)始人兼CEO鄭洪坤指出行業(yè)核心痛點：“測序能找植物的基因，但代謝組才懂它的‘品質’！”他表示，現(xiàn)在代謝組在農業(yè)里的用處還沒完全打開，未來要靠 “測序 + 代謝組” 組合拳，比如在育種環(huán)節(jié)通過基因篩選鎖定潛力品種，再以代謝組驗證維生素含量等品質指標，提升育種效率與準確性。
百譜生物總經理曹以襯公布近期發(fā)展規(guī)劃：這款植物廣靶定量代謝組學產品，是我們團隊潛心研發(fā)的核心成果——它打破了傳統(tǒng)技術在檢測靈敏度、數(shù)據(jù)庫覆蓋度上的局限，將成為植物研究領域的高效工具！未來我們將聯(lián)合頂尖設備廠商升級檢測平臺，進一步提升超微量代謝物檢測能力，為農業(yè)科研創(chuàng)新、品種改良與產業(yè)升級提供關鍵支撐。
專家實踐驗證：技術落地解決產業(yè)實際難題
中國科學院海洋研究所段德麟研究員表示：傳統(tǒng)品質研究像“看表面癥狀”，難知代謝層面連鎖反應；定量代謝組技術能幫我們“找病根”：可定量脅迫下小分子代謝物變化，整合數(shù)據(jù)構建完整代謝調控網絡，還能測低含量抗逆物質提供精準標志物，培育口感更好、風味更佳的品種。
北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院王旭教授以辣椒研究為例：“傳統(tǒng)依賴感官評價判斷辣椒辛辣度，精準度低且主觀性強。該技術可定量檢測辣椒素合成的多種中間產物，我們已通過其篩選出維生素C高含量的辣椒品種，推動品質育種升級?！?/p>
中國科學院海洋研究所張立濤副研究員認為：傳統(tǒng)方法研究微藻蝦青素合成途徑，僅能發(fā)現(xiàn)終產物變化，無法定位影響關鍵代謝物的中間途徑，尤其是強光、氮源等因素調控不同產物的分支途徑。植物廣靶定量代謝組學技術可精準識別終產物及其中間產物，為提升微藻中活性物質合成提供了明確的方向。
北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院王旭教授（左二）、中國科學院海洋研究所段德麟研究員（右二）、中國科學院海洋研究所張立濤副研究員（右一）
新聞相關報道
?9?月?17?日，百邁客生物推出的植物廣靶定量代謝技術，標志著植物代謝組學正式進入廣靶、精準、實用的新階段，未來將在功能食品開發(fā)、作物育種優(yōu)化、農業(yè)抗逆管理等多個方面發(fā)揮深遠影響。>>詳情
2025?年?9?月?17?日，由百邁客生物與百譜生物聯(lián)合主辦的?“植物廣靶定量代謝組學發(fā)布會”?在青島成功舉辦。會上推出的植物廣靶定量代謝組學技術，為植物基礎研究與農業(yè)產業(yè)升級注入新動能，引發(fā)行業(yè)廣泛關注。中國科學院海洋研究所段德麟研究員、北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院王旭教授等專家出席。>>詳情
2025 年 9 月 17 日，在青島舉辦的“植物廣靶定量代謝組學發(fā)布會”上。百邁客生物與百譜生物聯(lián)合推出植物廣靶定量代謝組學技術，為植物基礎研究與農業(yè)產業(yè)升級注入新動能，引發(fā)行業(yè)廣泛關注。中國科學院海洋研究所段德麟研究員、北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院王旭教授等專家與企業(yè)代表應邀出席。>>詳情
9月17日，新一代植物廣靶定量代謝組學技術在青島自貿片區(qū)發(fā)布，該技術使得植物在抗逆、品質形成過程中微量積累的關鍵代謝物得以清晰捕捉，為深入研究植物生理機制注入新的科研動力。中國科學院海洋研究所段德麟研究員等行業(yè)專家受邀出席。>>詳情
9月17日，百邁客生物在青島自貿片區(qū)發(fā)布新一代植物廣靶定量代謝組學技術，該技術直面植物研究領域長期存在的三大核心難題：檢測靈敏度低、代謝物覆蓋范圍有限、缺乏精準定量的內標方法，通過多維創(chuàng)新提升植物代謝組學研究的效率與準確性。>>詳情
2025年9月17日，百邁客生物與百譜生物聯(lián)合發(fā)布“植物廣靶定量代謝組學技術” 。該技術采用?AB SCIEX QTRAP7500?高靈敏度檢測平臺，將檢測限降低一個數(shù)量級，相較于傳統(tǒng)?SCIEX Triple Quad? 6500 +?平臺，對低豐度植物代謝物、特殊滲透調節(jié)物質等低含量成分的檢測能力顯著提升。為深入研究植物生理機制提供更多可能。>>詳情
9月17日，百邁客生物與百譜生物聯(lián)合發(fā)布“植物廣靶定量代謝組學技術” 。這一技術使得植物在抗逆、品質形成過程中微量積累的關鍵代謝物得以清晰捕捉，為深入研究植物生理機制提供了技術可能。中國科學院海洋研究所段德麟研究員、北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院王旭教授等行業(yè)專家及企業(yè)代表受邀出席。>>詳情
植物研究領域受限于檢測靈敏度不足、代謝物數(shù)據(jù)庫不全、缺乏精準內標定量等問題，尤其是在非模式植物研究中，微量代謝物難以捕捉、關鍵成分易漏檢誤判、定量結果準確性不足等痛點，嚴重制約了研究效率與產業(yè)應用進程。此次發(fā)布的植物廣靶定量代謝組學技術，針對性提出多維度解決方案。>>詳情
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本次調研由北京科技創(chuàng)新促進中心黨委書記李萍帶隊，科技服務業(yè)部部長付文均、城市科技部部長曲宏，以及北京醫(yī)藥健康科技發(fā)展中心前沿部部長李潛等領導共同參與；百邁客生物聯(lián)合創(chuàng)始人王瑞、財務負責人蔣躍征等陪同接待，并與調研團隊進行座談交流。
座談會上，王瑞首先對市科委領導一行的到來表示熱烈歡迎，并圍繞百邁客生物的發(fā)展歷程、核心業(yè)務板塊、核心技術優(yōu)勢，以及未來在基因科技領域的長期戰(zhàn)略布局作詳細介紹。她強調，百邁客生物始終以?“技術創(chuàng)新驅動產業(yè)發(fā)展”?為核心理念，深耕生命科學領域，致力于為生命科學領域提供高質量的產品與服務。
隨后，市科委各位領導結合各自分管領域，針對百邁客生物的發(fā)展痛點與未來方向，提出了兼具專業(yè)性與指導性的建議：
李萍書記對百邁客生物在基因科技領域的科技創(chuàng)新突破及產業(yè)轉化方面取得的成果給予高度肯定。她明確表示，市科委將進一步加大對科技服務型企業(yè)的扶持力度，尤其在研發(fā)投入、人才引進、平臺建設等方面提供更多政策賦能，助力企業(yè)攻克技術難關、擴大發(fā)展規(guī)模。
李潛部長聚焦醫(yī)藥健康領域前沿技術的政策導向，結合行業(yè)人才需求趨勢，為百邁客生物解讀了最新政策支持方向，幫助企業(yè)更好把握行業(yè)機遇、應對發(fā)展挑戰(zhàn)。
付文均部長圍繞?“科技服務業(yè)與企業(yè)需求深度融合”?的核心，提出了具體建議。
曲宏部長則結合百邁客生物的技術特點，從科技應用場景拓展、產學研合作等方面，提供了系統(tǒng)性的指導思路，為企業(yè)拓寬發(fā)展邊界提供參考。
此次調研不僅深化了市科委對百邁客生物發(fā)展現(xiàn)狀與核心需求的精準了解，更為企業(yè)后續(xù)在政策對接、資源整合、戰(zhàn)略規(guī)劃等方面提供了明確的方向和支持等方面提供了明確的方向指引與支持。百邁客生物將以此為契機，進一步加強與政府部門的常態(tài)化溝通協(xié)作，加速科技創(chuàng)新與成果轉化，為推動北京國際科技創(chuàng)新中心建設、助力基因科技行業(yè)高質量發(fā)展積極貢獻企業(yè)力量。
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BH1000時空成像系統(tǒng)
成像在空間轉錄組實驗中的重要作用
空間轉錄組測序技術，其核心在于將測序數(shù)據(jù)與精確的成像相結合。然而，實踐中我們有時會不自覺地將焦點過度集中在測序數(shù)據(jù)上，而忽略了同樣關鍵的成像環(huán)節(jié)。在空間轉錄組實驗的全過程中，其中有三個關鍵步驟需要成像：
結構確認
在樣本完成質檢并合格后，需要對研究的目標區(qū)域進行確認，可以利用BH1000進行高清（標配高品質平場復消色差物鏡，20×物鏡，數(shù)值孔徑N.A.≥0.8,?同時最多支持拓展4個物鏡）的明場成像來進行判斷。
組織優(yōu)化
通過BH1000快速（20X，8mm*8mm,小于50S）得到高清明場圖像與高清的熒光（支持7個熒光通道,各通道有獨立傳感器，電動切換，標配明場、?DAPI、FITC和CY3）成像結果來選擇最優(yōu)的透化時間（需要選擇熒光最亮且符合相應明場結構無明顯逸散的梯度）
基因表達
可以利用BH1000對明場及熒光掃描過程中經常出現(xiàn)的拼接錯誤進行校準（自主研發(fā)BMCHiper軟件，搭配自研半透半返模塊，實現(xiàn)圖像無錯校準），得到原片無錯高清的熒光圖像與原片無錯高清的明場圖像，為后續(xù)空間數(shù)據(jù)準確的定位和可視化提供基礎，使得復雜的轉錄組數(shù)據(jù)能夠轉化為最直觀，最精準的生物學見解。
BMKMANU BH1000產品
BMKMANU BH1000是專門適配精準空間組學BMKMANU S系列產品的成像系統(tǒng)，它不僅可以實現(xiàn)各類物種及各類玻片標本的快速全切片掃描成像，還能能夠滿足百創(chuàng)空間組學中各個實驗環(huán)節(jié)的成像需求，更能搭配使用百創(chuàng)細胞分割算法，結合其輸出的原片無錯高清明場成像，原片無錯高清熒光成像實現(xiàn)精準空間單細胞分割。
產品參數(shù)
產品優(yōu)勢
用戶友好型界面，可實現(xiàn)一鍵式操作，自動對焦、自動掃描，圖像質量優(yōu)異
50S內可完成8mm*8mm 20X掃描，支持掃描25mm*60mm,原片明場及原片熒光成像
多層掃描：支持多景深模式和融合模式
支持多區(qū)域掃描
精準細胞分割：內嵌圖像校準模式，可以實現(xiàn)對圖像進行校準拼接，直接輸出原片無錯圖像
七通道多色熒光
拓展應用范圍
“療猘犬咬人方，仍殺所咬犬，取腦敷之，后不復發(fā)”—東晉?葛洪《肘后備急方》
這是最早關于人類免疫學應用的記錄。公元前?400?年，中國可能已有人痘苗接種預防天花的方法，到?16?世紀明朝隆慶年間，人痘接種法得到重大改進并廣泛應用，17?世紀傳入俄國、朝鮮、日本、土耳其和英國等國家，至18世紀末結束經驗免疫學時期，隨后免疫學又經歷了經典免疫學時期，近代免疫學時期，直到1965年/1968年?B細胞/T細胞的發(fā)現(xiàn)開啟了現(xiàn)代免疫學時期。
隨著免疫學的逐步發(fā)展，免疫組學技術也隨之進入了迅速發(fā)展的時期，先后發(fā)展出了標記免疫組技術、免疫組化技術、Bulk?T/BCR測序技術以及近幾年興起的單細胞T/BCR測序技術，并帶動了相關科學的進步。
2017年，張澤民院士研究組，通過大規(guī)模單細胞測序技術對肝癌相關T淋巴細胞進行分析，首次在單細胞水平上描繪肝癌微環(huán)境中免疫細胞圖譜，發(fā)現(xiàn)了肝癌免疫療法的潛在靶點，也為我們從多角度系統(tǒng)性理解肝癌T淋巴細胞特征奠定了基礎。（2017，Cell，Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing）
2024年，復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士和高強教授、中國科學院上海免疫與感染研究所張曉明研究員、浙江大學基礎醫(yī)學院郭國驥教授合作在Science上發(fā)表了題為A blueprint for tumor-infiltrating B cells across human cancers的研究論文，結合單細胞轉錄組、 B細胞受體免疫組庫和表觀基因組的多組學數(shù)據(jù)，系統(tǒng)性地刻畫了腫瘤浸潤性B細胞的異質性、動態(tài)分化和表觀調控機制。創(chuàng)新地揭示了腫瘤微環(huán)境中廣泛存在的EF應答的癌種偏好性、空間定位特征、臨床意義及潛在的誘導調控機制。
但是，與逐漸成熟的單細胞T/BCR測序不同，空間T/BCR測序測序技術還一直未能有較好的測序技術產品去做支撐，成果尚少，現(xiàn)有的文章技術還局限于使用早期的低分辨率轉錄芯片為依托。成熟穩(wěn)定且高分辨率的空間T/BCR測序技術產品的缺乏限制了空間免疫組的研究。
百創(chuàng)空間全長免疫組庫測序技術?BMKMANU?S3000-VDJ
2024年12月，百邁客生物智能制造以廣受市場好評的亞細胞級S系列空間轉錄組芯片為依托，開發(fā)出了在原片上可同時捕獲3’端轉錄組信息以及全長B細胞受體（BCR）和T細胞受體（TCR）序列的空間T/BCR測序技術產品—BMKMANU?S3000-VDJ?，將填補這一技術產品的缺口。
實測案例-某腫瘤-百創(chuàng)單細胞級空間免疫組結果
BMKMANU?S3000-VDJ?技術，使用新鮮OCT包埋樣本，在分辨率為3.5μm的芯片上同一張組織切片（10μm）實現(xiàn)3’端mRNA，以及全長TCR/BCR的捕獲。利用百邁客生物智能制造獨有的圖像校準及細胞分割技術，得到單細胞級分辨率的空間轉錄組結果及單細胞級分辨率的空間T/BCR數(shù)據(jù)。
BMKMANU?S3000-VDJ??技術路線
精準空間細胞注釋
得到的單細胞級空間轉錄組結果，可以進行常規(guī)的空間轉錄組分析，并進行精準的細胞注釋。
精準細胞注釋及T/B細胞的空間分布
T/B細胞的亞群定位
對于得到的T細胞及B細胞又可以繼續(xù)進行詳細的亞群分類，同時探討亞群之前的相互轉換關系以及與表型之前的關系。
T/B Cells 亞群分類，亞群空間分布及亞群發(fā)育軌跡分析
TCR/BCR?空間分布以及豐度分析
TCR和BCR的豐度分析可以揭示免疫反應的多樣性和動態(tài)變化。例如，TCR的多樣性在腫瘤進展過程中會發(fā)生變化，早期肝癌患者的TCR和BCR均勻性更高，而晚期患者則表現(xiàn)出較低的均勻性。此外，TCR和BCR的豐度變化也可以反映免疫細胞的激活狀態(tài)和克隆擴增情況。
克隆型空間分布以及豐度分析
腫瘤樣本我們可以類比為一處具有復雜地貌的特殊地理環(huán)境，不同的環(huán)境造就了各種細胞的不同狀態(tài)，而T/B細胞在不同的“選擇壓力”下邊進行了不同的“適應性進化”。對不同生態(tài)位的T/B細胞尤其是TCR/BCR進行測定，有助于我們去揭示免疫細胞的克隆起源和進化過程。例如，通過分析TCR的VDJ重排，可以追蹤T細胞克隆的起源和擴增過程。這種分析有助于理解免疫細胞在不同生理和病理狀態(tài)下的動態(tài)變化。
百創(chuàng)單細胞級空間全長免疫組產品?BMKMANU?S3000-VDJ，將幫助科研者解決整個轉錄組和組織形態(tài)學問題，實現(xiàn)人類腫瘤或其它病變組織中B細胞和T細胞克隆的高保真定位和空間譜系追蹤，將在一定程度上促進對各種臨床相關現(xiàn)象（如感染、疫苗接種和癌癥）中淋巴細胞空間動力學的理解。
]]>劉恒康博士研究方向為利用空間多組學探究腫瘤細胞遺傳變異及其與微環(huán)境的相互作用在腫瘤演化過程中的規(guī)律和機制。在本次講座中劉博士分享了一篇發(fā)表于Cancer Cell的封面文章，其中百邁客生物為該研究提供了百創(chuàng)S1000空間轉錄組測序服務。
與以往研究不同的是，這篇文章在研究中同時納入原發(fā)灶以及侵襲性黑色素瘤，結合多組學技術手段，挖掘腫瘤侵襲的克隆演化規(guī)律的同時，發(fā)現(xiàn)了AM（原位肢端黑色素瘤）的C3分子亞型預后更差，這與C3亞型微環(huán)境中浸潤更多免疫細胞以及免疫抑制微環(huán)境相關。其中APOE+/CD163+巨噬細胞通過IGF1-IGF1R促進了腫瘤細胞EMT轉化，這一發(fā)現(xiàn)也在體外細胞共培養(yǎng)實驗、額外的患者隊列中得到了驗證，為臨床評估黑色素瘤患者預后提供了新的視角，即肢端型黑色素瘤組織中APOE+CD163+雙陽與患者更差預后相關。
首期 “一作面對面” 腫瘤專題講座圓滿收官，前沿干貨精彩紛呈！
百邁客生物 “一作面對面” 腫瘤專題系列講座將持續(xù)推出肺癌、肝癌、結直腸癌、胃癌、乳腺癌、宮頸癌、前列腺癌等多癌種專場，致力于打造腫瘤醫(yī)學領域前沿研究的高端分享平臺 —— 聚焦研究思路與成果的深度交流，探索臨床問題向科學研究的轉化路徑，解析前沿技術驅動的認知革新，并揭示科研成果的臨床價值落地邏輯。
誠邀腫瘤研究領域專家學者共聚云端
愿思維碰撞出的火花
最終變?yōu)榱一鸱賰舨⊥丛旄V大患者
7月9日19:30
我們下期再會！
]]>中山大學生命科學學院李霖鋒教授以“雜草稻的起源與適應性進化”為題，依托《Nature Communications》發(fā)表的題為”Porous borders at the wild-crop interface promote weed adaptation in Southeast Asia”?的文章，以文章中雜草稻基因組組裝及群體進化為基礎，延伸介紹了從雜草稻的表性調研及分類，馴化過程中的品系選育，馴化關鍵基因選擇以及雜草稻適應性進化研究對栽培水稻育種的重要作用等，整場演講深入淺出，引起了各位老師的熱烈討論。
北京大學現(xiàn)代農業(yè)研究院陳為凱副研究員陳老師則以“本氏煙草完整基因組揭示其著絲粒復雜結構及進化歷史”為題，詳細介紹了老師在《Nature Plants》發(fā)表的題為?“The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals the genetic and epigenetic landscape of centromeres”?的研究課題，演講內容從煙草的T2T基因組組裝開始，深入分析了不同物種著絲粒標志序列特征并對其進行分類，整合Chip-seq及甲基化數(shù)據(jù)共同構建了本氏煙草著絲粒形成和進化的模型，該模型涉及新著絲粒的形成及反轉錄轉座子等方面信息，整場演講內容詳盡思路完整，也引發(fā)了各位在場老師的思考。
百邁客生物高級產品經理聶寧寧圍繞兩位學者研究中涉及的基因組學與群體進化研究相關組學工具展開深度解析。
這場學術盛宴雖已落幕，但其引發(fā)的思考與探索仍在持續(xù)。7月16日14:00，我們將迎來第二期直播。屆時，將有新的行業(yè)權威專家匯聚一堂，圍繞作物育種領域的新興技術、前沿理論等展開深入探討，為大家?guī)砀嚓P于作物育種的創(chuàng)新思路與解決方案。
請持續(xù)關注百邁客生物官方消息，讓我們共同期待7月16日再次相聚云端，共探作物育種新前沿！
]]>為了推動動物腸道微生物的深入研究，2025年6月24日，百邁客生物特邀三位深耕該領域的權威專家，以動物營養(yǎng)為核心，開展此次主題學術沙龍，圍繞動物腸道微生態(tài)調控、菌群功能解析、宿主互作機制等熱點議題，帶來高水準學術報告。這不僅是一場知識與思想的盛宴，更是探索動物健康養(yǎng)殖、疾病防控新路徑的交流平臺，讓我們共同探討動物腸道微生物世界的無限可能，攜手推動學科發(fā)展與技術革新！
會議聚焦：微觀世界大能量
一、反芻動物消化道微生物組互作與功能研究
本次沙龍中國農業(yè)科學院草原研究所劉孝珍老師探討了反芻動物消化道微生物組研究的重要性，并從不同方向展開：
- 微生物組研究:通過宏基因組組裝基因組技術，解析微生物組結構組成、與宿主和環(huán)境的關系以及其功能；
- 互作機制研究:?探究微生物之間的相互作用機制，例如群體感應以及這些機制如何影響微生物群落結構和功能；
- 暗物質開發(fā)與利用:?挖掘未被充分認知的微生物暗物質，包括未被培養(yǎng)的微生物類群、非編碼小RNA和未知代謝產物，并開發(fā)其潛在應用價值。
二、畜禽微生物研究的變與不變
本次沙龍西北農林科技大學武老師對國內外關于畜禽微生物組研究工作進行了整體梳理，從以下七個部分展開：
- 胃腸道微生物組目錄構建及功能挖掘：利用宏基因組及binning分析進行胃腸道宏基因組目錄構建及功能挖掘，并介紹了其他胃腸道微生物組研究方法；
- 胃腸道微生物互作研究：介紹微生物間互作關系，及互作關系的研究方法；
- 胃腸道微生物-宿主互作：介紹近幾年研究比較多的由胃腸道微生物所產生的代謝物，這些代謝物是如何調控宿主的一系列功能；
- 宿主-胃腸道微生物互作：該部分內容闡明了宿主是如何影響微生物，并介紹了一系列近幾年熱門的研究方法；
- 消化道穩(wěn)態(tài)營養(yǎng)與微生物功能調控：基于消化道健康的五環(huán)標準，開展消化道營養(yǎng)研究，例如圍繞生產效率低下、階段性代謝性疾病多和飼料飼草資源短缺等方向開展飼料養(yǎng)分高效利用的研究；
- 科赫法則-從微生物到微生物組：介紹了微生物時代的”科赫法則”，如何去實現(xiàn)由因果關系到因果機制的驗證，未來又該從哪些角度去展開；
- 高顏值在線數(shù)據(jù)分析、繪圖與論文組圖
三、“腸-生殖”軸建立的作用機制探究
本次沙龍內蒙古大學周揚老師介紹了她近幾年的研究成果，基于“腸-生殖”軸建立的相關作用機制，進一步去開發(fā)羊營養(yǎng)代謝性疾病的繁殖調控技術，研發(fā)提高羊精液品質的飼料添加劑。
- 腸-睪軸：構建羊代謝紊亂模型，紊亂模型中精子發(fā)生異常、質量下降，研究發(fā)現(xiàn)菌群失調影響膽汁酸水平進而影響維生素A吸收，維生素A吸收受阻影響精子發(fā)生，闡明了代謝性紊亂誘發(fā)的反芻動物羊繁殖力下降的腸-睪軸新機制；
- 腸-睪軸：MLT通過改善腸道菌群的微生態(tài)系統(tǒng)，挽救了代謝素亂疾病引發(fā)的精子發(fā)生異常和睪丸細胞凋亡，為反芻動物羊由代謝素亂引發(fā)的繁殖疾病診斷和防治提供了新的思路；
- 基于腸-生殖軸進行后續(xù)研究：通過補充維生素B1來預防母體代謝紊亂對雌性后代繁殖性能的影響，這項研究為保護后代繁殖力提供了新的診療思路；
- 羊精準繁養(yǎng)育一體化：精準繁養(yǎng)助力良種培育:建立何時喂，喂多少，喂什么的標準。針對羊高產經濟性狀(主要圍繞產肉、產奶)，依托已建立益生元庫，研發(fā)提升羊肉和羊奶品質的新技術和新產品。
通過今天的沙龍，我們對腸道菌群之間的協(xié)同互作，菌群對代謝的影響機制等科學問題有了更全面的認識，也對腸道菌群與宿主的互惠共生關系有了更深層次的理解。本次沙龍圓滿閉幕，我們將持續(xù)打造第五期微生物領域系列學術盛宴，屆時期待與您在科研長河中激蕩思想，共濺新浪花！
]]>發(fā)布會上，百創(chuàng)智造副總裁劉敏詳細介紹了百創(chuàng)空間ATAC-Seq技術原理，產品優(yōu)勢，應用場景及實測數(shù)據(jù)，通過百創(chuàng)獨有的S系列空間芯片作為底層拓展開發(fā)，實現(xiàn)單細胞級空間ATAC-seq，并表示DEMO數(shù)據(jù)預計1-2周發(fā)布。上海達澈生物高級產品經理王雨琦分享了使用百創(chuàng)空間ATAC-seq得到的實測數(shù)據(jù)。
百創(chuàng)空間ATAC-seq技術原理
百創(chuàng)空間ATAC-seq產品優(yōu)勢
01??提供ATAC的空間位置信息
傳統(tǒng)的 ATAC-Seq 技術雖然能夠揭示染色質的開放性，但無法提供細胞在組織中的空間位置信息。百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術，能夠在組織切片上直接進行染色質可及性分析，保留細胞的空間信息。
02?解碼基因表達的空間調控網絡
百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術能夠同時分析基因表達和基因調控機制，為空間生物學研究增加了新的維度。它可以幫助研究人員在空間維度繪制染色質可及性圖譜，揭示基因表達的調控機制。
03 多組學整合：從碎片到全景
空間ATAC-Seq與空間轉錄組、空間免疫組、原位熒光等技術聯(lián)用，實現(xiàn)“表觀遺傳-轉錄組-驗證”的多維數(shù)據(jù)整合。這種一體化策略，可幫助科學家在發(fā)育研究中構建更完整的調控網絡，甚至發(fā)現(xiàn)此前未知的關鍵通路。
百創(chuàng)空間ATAC-seq與百創(chuàng)S3000空間轉錄組對齊
百創(chuàng)空間ATAC-seq產品實測數(shù)據(jù)
小鼠胚胎
小鼠腦
肝臟腫瘤
百創(chuàng)智造自主研發(fā)的”空間ATAC-Seq全流程解決方案”，成功填補空間表觀遺傳學研究領域的商業(yè)化產品空白。該產品通過整合多維組學分析框架，突破性實現(xiàn)了染色質開放區(qū)域的三維空間解析，為科研工作者構建”時空分辨-基因調控”研究體系提供關鍵工具。其創(chuàng)新性技術方案將深度賦能發(fā)育分化機制解析、腫瘤免疫微環(huán)境解碼、神經退行性疾病研究等重大科學命題。
未來，百創(chuàng)智造將持續(xù)以技術創(chuàng)新驅動行業(yè)發(fā)展，與全球科研伙伴攜手，共同解鎖生命科學的更多未知奧秘，讓空間生物學研究從 “單一視角” 邁向 “全景解析” 的新時代！
在測序技術的不斷發(fā)展中，DNBseq及SURFseq?等國產測序儀的強勢崛起給國內育種科學家提供了多元選擇：DNBseq主要基于DNBSEQ 技術（DNA納米球測序技術），結合聯(lián)合探針錨定聚合（cPAS）技術實現(xiàn)高通量測序；SURFseq基于“可逆末端終止測序法”技術路線，突破性推出TB級別桌面測序儀，縮短測序周期。目前，這兩種二代測序技在作物育種中具有廣泛的應用，顯著提高育種效率、降低成本，并加速優(yōu)良品種的培育。
SURFseq&DNBSEQ平臺協(xié)助作物領域研究實例
文章題目：Improving Seed Shattering Resistance in Wild O. alta Rice with Mesoporous Silica Nanoparticle Delivery Systems[1]
中文題目：介孔二氧化硅納米粒子遞送系統(tǒng)提高野生稻種子易碎抗性
發(fā)表時間：2024.09
當前全球局勢下氣候的劇烈變化及人口進一步增長加劇了對糧食作物需求的增長，在農業(yè)中會利用野生稻對栽培水稻進行種質改良，這一過程的一個關鍵挑戰(zhàn)是針對種子破碎的問題，種子破碎的物理結構是花梗中的脫落層（AL），其形成受環(huán)境因素和植物激素變化的影響，利用傳統(tǒng)基因工程靶向種子破碎相關基因的沉默或敲除可以產生種子不破碎的表型，但是難免會對其他表型產生影響，因此本研究開發(fā)了一種利用納米材料介孔二氧化硅納米顆粒（MSNs）改進CRISPR-Cas系統(tǒng)的方法對靶基因進行沉默，這種MSN-siRNA遞送系統(tǒng)可以作為一種靈活可逆的作物性狀改良工具。而其中利用真邁測序平臺SURFseq 5000進行轉錄組測序研究了MSN-siRNA遞送系統(tǒng)中各種成分對植物的影響，結果表明了MSN-siRNA傳遞系統(tǒng)可能通過克服植物細胞屏障，包括細胞壁和膜，有效地傳遞siRNA并誘導特定的生理反應。
文章題目：The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum[2]
中文題目：類纖維素合酶G3（CslG3）介導鐵皮石斛多糖合成和干旱脅迫反應
發(fā)表時間：2024.07
鐵皮石斛（Dendrobium catenatum）是一種著名的觀賞藥用植物，具有增強免疫力、抗氧化作用，這些效應歸因于生物活性次生代謝物的積累，包括多糖、類黃酮、生物堿、萜類化合物等，其中，多糖是鐵皮石斛的主要活性成分，具有增強免疫力、降血糖、抗氧化、抗疲勞和抗腫瘤作用，因此，多糖含量是鐵皮石斛的主要質量指標，葡甘露聚糖被認為是鐵皮石斛莖中的主要多糖，甘露糖與葡萄糖的比例不同，導致每種葡甘露聚糖的功能存在較大差異。許多研究表明，CesA?基因調節(jié)甘露聚糖合成，此外，SUS?可以與 CesA?相互作用，為細胞壁合成提供 UDP-葡萄糖，類纖維素合酶（Csl）基因與 CesA?家族基因具有高度序列相似性，在甘露聚糖的生物合成中起著至關重要的作用，為了挖掘導致多糖含量差異的功能基因，本研究基于DNBSEQ測序平臺，從兩個多糖含量由顯著差異品種的鐵皮石斛轉錄組中鑒定了 Csl?基因家族，并研究了它們的物理化學性質和系統(tǒng)發(fā)育關系，又進一步確定了 DcCslG3b?在不同組織中的亞細胞定位和表達模式，此外，還測試了 DcCslG3b?介導的非生物脅迫反應是否有助于孤立葉片的水分流失率。
文章題目：Sequencing and?analysis of?complete chloroplast genomes of?einkorn wheats?Triticum sinskajae and?Triticum monococcum accession k-20970[3]
中文題目：單粒小麥Triticum sinskajae和Triticum monococcum保藏號k-20970葉綠體全基因組測序與分析
發(fā)表時間：2024.01
單粒小麥包含一粒小麥（Triticum monococcum?L.），野生一粒小麥(Triticum boeoticum?Boiss.) 和烏拉爾圖小麥(Triticum urartu)三種二倍體小麥，而辛斯卡婭小麥（Triticum sinskajae）也經常被認為是第四種單粒小麥，辛斯卡婭小麥可長到120厘米高，特征為軟質的穗殼、較短但更密的穗、較大的小穗和發(fā)育較差的芒，光滑的光澤性穗殼等特征。辛斯卡婭小麥是一種研究較少的植物，很少被納入禾本科族的系統(tǒng)發(fā)育研究中，因此對其核基因組和葉綠體基因組進行測序非常重要，研究其在黑麥屬中的系統(tǒng)發(fā)育位置也非常有意義，然而目前還有不少科研人員認為將辛斯卡婭小麥作為一個獨立物種缺少足夠的證據(jù)，因此本次研究目標是測序并比較辛斯卡婭小麥和一粒小麥，以及野生一粒小麥的葉綠體基因組，以闡明黑麥的系統(tǒng)發(fā)育關系。本研究中基于真邁國產測序平臺Genolab M對辛斯卡婭小麥和一粒小麥，以及野生一粒小麥的葉綠體基因組進行了測序，結果表明辛斯卡婭小麥可能是由于生殖隔離產生的一種獨立物種，而不是一粒小麥的突變體。
DNBSEQ&SURFseq平臺協(xié)助作物領域測試結果展示
自10年前DNBSEQ測序技術的首款國產基因測序儀BGISEQ-500發(fā)布以來，DNBSEQ系列測序平臺已助力發(fā)表超1w+高質量文章，建立了國產測序儀的國際口碑，而近兩年來，SURFseq作為國產測序儀的新秀，也以其低成本，通量高及優(yōu)秀的數(shù)據(jù)表現(xiàn)逐漸受到科研人員的認可，以下是北京百邁客生物科技有限公司基于SURFseq測序平臺的測試數(shù)據(jù)結果展示
| 文庫 | 物種 | 平臺 | 原始產出（G） | 過濾有效率 | useQ30 | Mapped(%) | Unique_mapped | Conversion |
| Trans | 玉米 | NovaX | 8.57 | 94% | 94.53 | 88.1% | — | — |
| SURF | 8.60 | 97% | 95.98 | 89.1% | — |
— |
||
| WGS | 白菜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | 98.6% | — | 91.01% |
| SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | 98.8% | — | 91.23% | ||
| Lnc | 銀杏 | NovaX | 21.39 | 94% | 93.95 | 95.18% | — | |
| SURF | 19.86 | 97% | 95.96 | 95.91% | — | |||
| WGBS | 西瓜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | — | 38.84% | 99.58% |
| SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | — | 41.31% | 99.61% |
真邁SURFSeq 5000與主流進口測序儀同批樣本測試中數(shù)據(jù)表現(xiàn)
每種文庫類型上機4-8個重復，下機統(tǒng)計數(shù)據(jù)質量與基礎質控結果，可以看出SURFseq 5000測序結果整體產出數(shù)據(jù)高質量數(shù)據(jù)及有效數(shù)據(jù)比例更高，比對率覆蓋度等指標與Nova X plus平臺相比基本持平，數(shù)據(jù)質量穩(wěn)定可靠。
Trans及LncRNA文庫SURFseq 5000及Nova X plus平臺各重復樣本相關性統(tǒng)計，整體相關性在98%以上，數(shù)據(jù)分析結果與主流平臺結果一致性較高。
甲基化DMR分析結果顯示，SURFseq 5000 測序數(shù)據(jù)（Z007及Z008）鑒定DMR數(shù)要多于Nova X plus測序同批數(shù)據(jù)（B921-7及B921-8），且根據(jù)韋恩圖統(tǒng)計結果來看，SURFseq 5000 測序兩個重復樣本重合的DMR較Nova X plus測序的兩重復樣本更多，測序結果一致性更好。實測數(shù)據(jù)顯示：SURFseq能夠完美復刻甚至優(yōu)于國際主流平臺的數(shù)據(jù)質量。
優(yōu)種計劃啟動!基因科技助力中國糧倉升級
2025年，為了加速國產優(yōu)質作物種質培育及推動優(yōu)化國內糧食作物產業(yè)結構，北京百邁客生物科技有限公司投放百萬補貼正式啟動【優(yōu)種計劃】! 該計劃將聚焦水稻、小麥、大豆等糧食作物及棉花，油菜等經濟作物，基于優(yōu)質國產平臺，覆蓋基因組學、群體研究、轉錄表觀組學等多種科研技術致力于構建國產種質資源基因數(shù)據(jù)庫，為培育高產、抗逆、優(yōu)質新品種提供精準導航。
一粒良種，萬物生長。讓我們用基因密碼解鎖豐收未來，共同筑牢大國糧倉根基，掃描下方二維碼報名即有機會加入本次科研助農計劃!
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【參考文獻】
1: Liu Z, Zhang J, Cai Y, Wang H, Luo M, Li J, Yu H, Meng X, Cao Y. Improving?Seed Shattering Resistance in Wild <i>O. alta</i> Rice with Mesoporous Silica?Nanoparticle Delivery Systems. Nano Lett. 2024 Sep 25;24(38):11823-11830. doi:10.1021/acs.nanolett.4c02297.
2:Hongyan Hou, Junxia Wu, Yu Zhang, Chenfei Lu, Wu Jiang, Yanghui Shen, Lanying Pan, Qingsong Shao, Aimin Lv,The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum,Scientia Horticulturae,https://doi.org/10.1016/j.scienta.2024.113514.
3:Kuluev, A., Kuluev, B., Mikhaylova, E. et al. Sequencing and analysis of complete chloroplast genomes of einkorn wheats Triticum sinskajae?and Triticum monococcum?accession k-20970. Genet Resour Crop Evol 71, 3347–3360 (2024). https://doi.org/10.1007/s10722-023-01843-x
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國家級專精特新“小巨人”是工業(yè)和信息化部為貫徹落實中共中央辦公廳、國務院辦公廳《關于促進中小企業(yè)健康發(fā)展的指導意見》《財政部工業(yè)和信息化部關于支持“專精特新”中小企業(yè)高質量發(fā)展的通知》有關要求，經各省級中小企業(yè)主管部門會同財政部門組織報送、專家審核等流程評選而出，是中小企業(yè)評定工作中最高等級、最具權威的榮譽稱號。
專精特新“小巨人”企業(yè)是“專精特新”企業(yè)中的佼佼者，也是專注于產業(yè)細分市場、創(chuàng)新能力強、市場占有率高、掌握產業(yè)鏈關鍵環(huán)節(jié)核心技術、質量效益優(yōu)的排頭兵企業(yè)。
百邁客生物獲得國家級專精特新“小巨人”企業(yè)認定，不僅是對公司深耕基因測序領域開展技術創(chuàng)新、市場開拓、管理提升、戰(zhàn)略轉型等方面所取得成果的認可，更是對公司長期以來堅持自主創(chuàng)新，強化研發(fā)投入的高度肯定。未來，百邁客生物將充分發(fā)揮專、精、特、新的企業(yè)優(yōu)勢，加強技術創(chuàng)新，不斷提升產品質量和市場競爭力，為行業(yè)發(fā)展做出更大貢獻！