]]>在測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展中，DNBseq及SURFseq?等國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的強(qiáng)勢(shì)崛起給國(guó)內(nèi)育種科學(xué)家提供了多元選擇：DNBseq主要基于DNBSEQ 技術(shù)（DNA納米球測(cè)序技術(shù)），結(jié)合聯(lián)合探針錨定聚合（cPAS）技術(shù)實(shí)現(xiàn)高通量測(cè)序；SURFseq基于“可逆末端終止測(cè)序法”技術(shù)路線(xiàn)，突破性推出TB級(jí)別桌面測(cè)序儀，縮短測(cè)序周期。目前，這兩種二代測(cè)序技在作物育種中具有廣泛的應(yīng)用，顯著提高育種效率、降低成本，并加速優(yōu)良品種的培育。
SURFseq&DNBSEQ平臺(tái)協(xié)助作物領(lǐng)域研究實(shí)例
文章題目：Improving Seed Shattering Resistance in Wild O. alta Rice with Mesoporous Silica Nanoparticle Delivery Systems[1]
中文題目：介孔二氧化硅納米粒子遞送系統(tǒng)提高野生稻種子易碎抗性
發(fā)表時(shí)間：2024.09
當(dāng)前全球局勢(shì)下氣候的劇烈變化及人口進(jìn)一步增長(zhǎng)加劇了對(duì)糧食作物需求的增長(zhǎng)，在農(nóng)業(yè)中會(huì)利用野生稻對(duì)栽培水稻進(jìn)行種質(zhì)改良，這一過(guò)程的一個(gè)關(guān)鍵挑戰(zhàn)是針對(duì)種子破碎的問(wèn)題，種子破碎的物理結(jié)構(gòu)是花梗中的脫落層（AL），其形成受環(huán)境因素和植物激素變化的影響，利用傳統(tǒng)基因工程靶向種子破碎相關(guān)基因的沉默或敲除可以產(chǎn)生種子不破碎的表型，但是難免會(huì)對(duì)其他表型產(chǎn)生影響，因此本研究開(kāi)發(fā)了一種利用納米材料介孔二氧化硅納米顆粒（MSNs）改進(jìn)CRISPR-Cas系統(tǒng)的方法對(duì)靶基因進(jìn)行沉默，這種MSN-siRNA遞送系統(tǒng)可以作為一種靈活可逆的作物性狀改良工具。而其中利用真邁測(cè)序平臺(tái)SURFseq 5000進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究了MSN-siRNA遞送系統(tǒng)中各種成分對(duì)植物的影響，結(jié)果表明了MSN-siRNA傳遞系統(tǒng)可能通過(guò)克服植物細(xì)胞屏障，包括細(xì)胞壁和膜，有效地傳遞siRNA并誘導(dǎo)特定的生理反應(yīng)。
文章題目：The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum[2]
中文題目：類(lèi)纖維素合酶G3（CslG3）介導(dǎo)鐵皮石斛多糖合成和干旱脅迫反應(yīng)
發(fā)表時(shí)間：2024.07
鐵皮石斛（Dendrobium catenatum）是一種著名的觀(guān)賞藥用植物，具有增強(qiáng)免疫力、抗氧化作用，這些效應(yīng)歸因于生物活性次生代謝物的積累，包括多糖、類(lèi)黃酮、生物堿、萜類(lèi)化合物等，其中，多糖是鐵皮石斛的主要活性成分，具有增強(qiáng)免疫力、降血糖、抗氧化、抗疲勞和抗腫瘤作用，因此，多糖含量是鐵皮石斛的主要質(zhì)量指標(biāo)，葡甘露聚糖被認(rèn)為是鐵皮石斛莖中的主要多糖，甘露糖與葡萄糖的比例不同，導(dǎo)致每種葡甘露聚糖的功能存在較大差異。許多研究表明，CesA?基因調(diào)節(jié)甘露聚糖合成，此外，SUS?可以與 CesA?相互作用，為細(xì)胞壁合成提供 UDP-葡萄糖，類(lèi)纖維素合酶（Csl）基因與 CesA?家族基因具有高度序列相似性，在甘露聚糖的生物合成中起著至關(guān)重要的作用，為了挖掘?qū)е露嗵呛坎町惖墓δ芑?，本研究基于DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)，從兩個(gè)多糖含量由顯著差異品種的鐵皮石斛轉(zhuǎn)錄組中鑒定了 Csl?基因家族，并研究了它們的物理化學(xué)性質(zhì)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，又進(jìn)一步確定了 DcCslG3b?在不同組織中的亞細(xì)胞定位和表達(dá)模式，此外，還測(cè)試了 DcCslG3b?介導(dǎo)的非生物脅迫反應(yīng)是否有助于孤立葉片的水分流失率。
文章題目：Sequencing and?analysis of?complete chloroplast genomes of?einkorn wheats?Triticum sinskajae and?Triticum monococcum accession k-20970[3]
中文題目：?jiǎn)瘟Ｐ←?em>Triticum sinskajae和Triticum monococcum保藏號(hào)k-20970葉綠體全基因組測(cè)序與分析
發(fā)表時(shí)間：2024.01
單粒小麥包含一粒小麥（Triticum monococcum?L.），野生一粒小麥(Triticum boeoticum?Boiss.) 和烏拉爾圖小麥(Triticum urartu)三種二倍體小麥，而辛斯卡婭小麥（Triticum sinskajae）也經(jīng)常被認(rèn)為是第四種單粒小麥，辛斯卡婭小麥可長(zhǎng)到120厘米高，特征為軟質(zhì)的穗殼、較短但更密的穗、較大的小穗和發(fā)育較差的芒，光滑的光澤性穗殼等特征。辛斯卡婭小麥?zhǔn)且环N研究較少的植物，很少被納入禾本科族的系統(tǒng)發(fā)育研究中，因此對(duì)其核基因組和葉綠體基因組進(jìn)行測(cè)序非常重要，研究其在黑麥屬中的系統(tǒng)發(fā)育位置也非常有意義，然而目前還有不少科研人員認(rèn)為將辛斯卡婭小麥作為一個(gè)獨(dú)立物種缺少足夠的證據(jù)，因此本次研究目標(biāo)是測(cè)序并比較辛斯卡婭小麥和一粒小麥，以及野生一粒小麥的葉綠體基因組，以闡明黑麥的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。本研究中基于真邁國(guó)產(chǎn)測(cè)序平臺(tái)Genolab M對(duì)辛斯卡婭小麥和一粒小麥，以及野生一粒小麥的葉綠體基因組進(jìn)行了測(cè)序，結(jié)果表明辛斯卡婭小麥可能是由于生殖隔離產(chǎn)生的一種獨(dú)立物種，而不是一粒小麥的突變體。
DNBSEQ&SURFseq平臺(tái)協(xié)助作物領(lǐng)域測(cè)試結(jié)果展示
自10年前DNBSEQ測(cè)序技術(shù)的首款國(guó)產(chǎn)基因測(cè)序儀BGISEQ-500發(fā)布以來(lái)，DNBSEQ系列測(cè)序平臺(tái)已助力發(fā)表超1w+高質(zhì)量文章，建立了國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的國(guó)際口碑，而近兩年來(lái)，SURFseq作為國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀的新秀，也以其低成本，通量高及優(yōu)秀的數(shù)據(jù)表現(xiàn)逐漸受到科研人員的認(rèn)可，以下是北京百邁客生物科技有限公司基于SURFseq測(cè)序平臺(tái)的測(cè)試數(shù)據(jù)結(jié)果展示
| 文庫(kù) | 物種 | 平臺(tái) | 原始產(chǎn)出（G） | 過(guò)濾有效率 | useQ30 | Mapped(%) | Unique_mapped | Conversion |
| Trans | 玉米 | NovaX | 8.57 | 94% | 94.53 | 88.1% | — | — |
| SURF | 8.60 | 97% | 95.98 | 89.1% | — |
— |
||
| WGS | 白菜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | 98.6% | — | 91.01% |
| SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | 98.8% | — | 91.23% | ||
| Lnc | 銀杏 | NovaX | 21.39 | 94% | 93.95 | 95.18% | — | |
| SURF | 19.86 | 97% | 95.96 | 95.91% | — | |||
| WGBS | 西瓜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | — | 38.84% | 99.58% |
| SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | — | 41.31% | 99.61% |
真邁SURFSeq 5000與主流進(jìn)口測(cè)序儀同批樣本測(cè)試中數(shù)據(jù)表現(xiàn)
每種文庫(kù)類(lèi)型上機(jī)4-8個(gè)重復(fù)，下機(jī)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)質(zhì)量與基礎(chǔ)質(zhì)控結(jié)果，可以看出SURFseq 5000測(cè)序結(jié)果整體產(chǎn)出數(shù)據(jù)高質(zhì)量數(shù)據(jù)及有效數(shù)據(jù)比例更高，比對(duì)率覆蓋度等指標(biāo)與Nova X plus平臺(tái)相比基本持平，數(shù)據(jù)質(zhì)量穩(wěn)定可靠。
Trans及LncRNA文庫(kù)SURFseq 5000及Nova X plus平臺(tái)各重復(fù)樣本相關(guān)性統(tǒng)計(jì)，整體相關(guān)性在98%以上，數(shù)據(jù)分析結(jié)果與主流平臺(tái)結(jié)果一致性較高。
甲基化DMR分析結(jié)果顯示，SURFseq 5000 測(cè)序數(shù)據(jù)（Z007及Z008）鑒定DMR數(shù)要多于Nova X plus測(cè)序同批數(shù)據(jù)（B921-7及B921-8），且根據(jù)韋恩圖統(tǒng)計(jì)結(jié)果來(lái)看，SURFseq 5000 測(cè)序兩個(gè)重復(fù)樣本重合的DMR較Nova X plus測(cè)序的兩重復(fù)樣本更多，測(cè)序結(jié)果一致性更好。實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)顯示：SURFseq能夠完美復(fù)刻甚至優(yōu)于國(guó)際主流平臺(tái)的數(shù)據(jù)質(zhì)量。
優(yōu)種計(jì)劃啟動(dòng)!基因科技助力中國(guó)糧倉(cāng)升級(jí)
2025年，為了加速?lài)?guó)產(chǎn)優(yōu)質(zhì)作物種質(zhì)培育及推動(dòng)優(yōu)化國(guó)內(nèi)糧食作物產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)，北京百邁客生物科技有限公司投放百萬(wàn)補(bǔ)貼正式啟動(dòng)【優(yōu)種計(jì)劃】! 該計(jì)劃將聚焦水稻、小麥、大豆等糧食作物及棉花，油菜等經(jīng)濟(jì)作物，基于優(yōu)質(zhì)國(guó)產(chǎn)平臺(tái)，覆蓋基因組學(xué)、群體研究、轉(zhuǎn)錄表觀(guān)組學(xué)等多種科研技術(shù)致力于構(gòu)建國(guó)產(chǎn)種質(zhì)資源基因數(shù)據(jù)庫(kù)，為培育高產(chǎn)、抗逆、優(yōu)質(zhì)新品種提供精準(zhǔn)導(dǎo)航。
一粒良種，萬(wàn)物生長(zhǎng)。讓我們用基因密碼解鎖豐收未來(lái)，共同筑牢大國(guó)糧倉(cāng)根基，掃描下方二維碼報(bào)名即有機(jī)會(huì)加入本次科研助農(nóng)計(jì)劃!
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【參考文獻(xiàn)】
1: Liu Z, Zhang J, Cai Y, Wang H, Luo M, Li J, Yu H, Meng X, Cao Y. Improving?Seed Shattering Resistance in Wild <i>O. alta</i> Rice with Mesoporous Silica?Nanoparticle Delivery Systems. Nano Lett. 2024 Sep 25;24(38):11823-11830. doi:10.1021/acs.nanolett.4c02297.
2:Hongyan Hou, Junxia Wu, Yu Zhang, Chenfei Lu, Wu Jiang, Yanghui Shen, Lanying Pan, Qingsong Shao, Aimin Lv,The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum,Scientia Horticulturae,https://doi.org/10.1016/j.scienta.2024.113514.
3:Kuluev, A., Kuluev, B., Mikhaylova, E. et al. Sequencing and analysis of complete chloroplast genomes of einkorn wheats Triticum sinskajae?and Triticum monococcum?accession k-20970. Genet Resour Crop Evol 71, 3347–3360 (2024). https://doi.org/10.1007/s10722-023-01843-x
]]>此次系列培訓(xùn)班主題內(nèi)容為生信入門(mén)基礎(chǔ)課程、比較基因組學(xué)生信課程、單細(xì)胞生信分析課程，主要面向零基礎(chǔ)的、有數(shù)據(jù)分析及繪圖展示需求的學(xué)員。本期培訓(xùn)班共有70名來(lái)自全國(guó)各地的老師參加。在為期3天的課程中，學(xué)員們?cè)谥v課老師的帶領(lǐng)下系統(tǒng)的學(xué)習(xí)了生信入門(mén)基礎(chǔ)知識(shí)、比較基因組學(xué)、單細(xì)胞生信分析等生信分析課程。
同時(shí)，在學(xué)習(xí)的過(guò)程中，我們的授課老師和助教現(xiàn)場(chǎng)為大家解答在實(shí)際操作中遇到的技術(shù)問(wèn)題。
老師在現(xiàn)場(chǎng)指導(dǎo)學(xué)員操作
由于許多學(xué)員都是零基礎(chǔ)學(xué)習(xí)，在課后復(fù)習(xí)時(shí)還是會(huì)碰到許多難以解決的問(wèn)題。我們?cè)谡n下會(huì)以QQ交流群的形式與學(xué)員進(jìn)行交流探討，提供指導(dǎo)，保障學(xué)員培訓(xùn)后的自我學(xué)習(xí)，從而更高效的完成學(xué)習(xí)目標(biāo)。
本屆微生物學(xué)會(huì)設(shè)有1個(gè)主會(huì)場(chǎng)以及10個(gè)分會(huì)場(chǎng)，包括“微生物–礦物相互作用及共演化”，“元素生物地球化學(xué)循環(huán)與全球變化”，“地質(zhì)微生物與能源轉(zhuǎn)化”，“地質(zhì)環(huán)境微生物與環(huán)境修復(fù)”，“大氣微生物與環(huán)境效應(yīng)”，“微生物與土壤健康”等10個(gè)熱點(diǎn)主題，由14位重量級(jí)前沿科研工作者及其課題組優(yōu)秀青年學(xué)者共同奉獻(xiàn)了超過(guò)130余場(chǎng)學(xué)術(shù)報(bào)告，其中大多主題利用了高通量測(cè)序工具克服了目前的研究瓶頸，極大提高了科研效率，吸引力500余位優(yōu)秀科研人員共同參與討論。
展會(huì)期間百邁客發(fā)揚(yáng)以科研為中心的優(yōu)秀企業(yè)精神，全程設(shè)立展位，展示了全方位微生物組研究相關(guān)組學(xué)產(chǎn)品，包括前沿組學(xué)工具?絕對(duì)定量微生物組學(xué)測(cè)序，高數(shù)據(jù)量全長(zhǎng)多樣性研究，?長(zhǎng)度長(zhǎng)宏基因組學(xué)，以及全方位探討生物學(xué)問(wèn)題的?動(dòng)植物-微生物互作多組學(xué)聯(lián)合分析應(yīng)用產(chǎn)品，與前來(lái)參會(huì)的研究學(xué)者熱烈討論了地質(zhì)微生物組學(xué)現(xiàn)有研究問(wèn)題與發(fā)展前景，吸引了大量?jī)?yōu)秀學(xué)者駐留探討。展位現(xiàn)場(chǎng)火爆，大家對(duì)不同的產(chǎn)品提出了不同的問(wèn)題，現(xiàn)場(chǎng)的工作人員都做了詳細(xì)的解答和交流。
后續(xù)百邁客將繼續(xù)關(guān)注多組學(xué)前沿研究，本著服務(wù)于科研的目的，為廣大科研工作者提供更多優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品和服務(wù)，從技術(shù)方法層面，推動(dòng)交叉學(xué)科領(lǐng)域的科學(xué)研究。
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第十屆全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇是中國(guó)基因產(chǎn)業(yè)具有影響力的行業(yè)峰會(huì)之一，為展示我國(guó)功能基因組學(xué)在多組學(xué)和大數(shù)據(jù)背景下的重大研究進(jìn)展，促進(jìn)功能基因組學(xué)各研究領(lǐng)域的交流與合作，加強(qiáng)行業(yè)信息與資源的共享以及成果轉(zhuǎn)化，在高通量測(cè)序技術(shù)、多組學(xué)分析方法及生物云蓬勃發(fā)展的背景下，本屆大會(huì)將邀請(qǐng)各界領(lǐng)域領(lǐng)軍者共同探索功能基因組學(xué)的新技術(shù)和新思路，以及大數(shù)據(jù)時(shí)代下的功能基因組學(xué)發(fā)展方向與未來(lái)！
會(huì)議信息
會(huì)議時(shí)間：2023年10月23日~10月27日
22日?qǐng)?bào)道，23日主會(huì)場(chǎng)，24日五個(gè)分會(huì)場(chǎng)(植物功能基因組學(xué)研究會(huì)場(chǎng)、動(dòng)物多組學(xué)應(yīng)用研究會(huì)場(chǎng)、微生物質(zhì)譜多組學(xué)研究會(huì)場(chǎng)、醫(yī)學(xué)多組學(xué)精準(zhǔn)診療應(yīng)用研究會(huì)場(chǎng)、時(shí)空多組學(xué)技術(shù)發(fā)展及應(yīng)用會(huì)場(chǎng))并行，25-27日為期刊講座及培訓(xùn)課程。
會(huì)議地點(diǎn)：山東省·青島市金沙灘希爾頓酒店
會(huì)議注冊(cè)費(fèi)：2500元/人
出席嘉賓
主題會(huì)場(chǎng)
植物功能基因組學(xué)研究會(huì)場(chǎng)主題會(huì)場(chǎng)
隨著基因組組裝(GA)、種質(zhì)資源鑒定(GC)、基因功能鑒定(GI)、基因組育種(GB)、基因編輯(GE)的5G育種策略快速發(fā)展，以高通量測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ)的組學(xué)研究已經(jīng)廣泛應(yīng)用于植物研究的各個(gè)領(lǐng)域。本會(huì)場(chǎng)特邀植物功能基因組學(xué)、系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)、表觀(guān)遺傳學(xué)等熱點(diǎn)領(lǐng)域?qū)＜引R聚一堂，分享植物研究的前沿技術(shù)、經(jīng)驗(yàn)成果及發(fā)展前景。
動(dòng)物多組學(xué)應(yīng)用研究會(huì)場(chǎng)
隨著高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息科學(xué)技術(shù)的蓬勃發(fā)展，生物大數(shù)據(jù)已然成為了二十一世紀(jì)有活躍力的技術(shù)領(lǐng)域。完整基因組構(gòu)建、動(dòng)態(tài)三維調(diào)控、功能基因定位、轉(zhuǎn)錄、蛋白&代謝、微生物等多組學(xué)技術(shù)，在動(dòng)物功能研究上日臻成熟。為了展示和交流動(dòng)物多組學(xué)領(lǐng)域的新成果、新進(jìn)展，共同探討動(dòng)物領(lǐng)域的熱點(diǎn)、難點(diǎn)問(wèn)題，本會(huì)場(chǎng)特邀動(dòng)物領(lǐng)域?qū)＜覍W(xué)者，圍繞動(dòng)物起源進(jìn)化及遺傳多樣性、動(dòng)物育種及生長(zhǎng)發(fā)育、重要功能性狀遺傳機(jī)制、動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與肉質(zhì)品質(zhì)、動(dòng)物環(huán)境適應(yīng)機(jī)制、動(dòng)物致病機(jī)理等研究主題，分享研究進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)成果。
微生物質(zhì)譜多組學(xué)研究會(huì)場(chǎng)
隨著測(cè)序技術(shù)、高分辨質(zhì)譜技術(shù)和多組學(xué)整合分析方法及數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展，微生物組學(xué)研究正在從單一組學(xué)向多組學(xué)(微生物聯(lián)合代謝/轉(zhuǎn)錄/蛋白等)技術(shù)發(fā)展。以多組學(xué)驅(qū)動(dòng)的微生物組學(xué)研究將帶來(lái)生命科學(xué)研究的新范式。微生物多組學(xué)現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于微生物資源與微生物組、病原微生物與健康、環(huán)境微生物與環(huán)境生物技術(shù)等領(lǐng)域。本會(huì)場(chǎng)特邀微生物組領(lǐng)域?qū)＜覍W(xué)者，圍繞微生物資源、微生物與人體健康、環(huán)境微生物等主題，共同分享微生物多組學(xué)研究進(jìn)展和研究成果。
醫(yī)學(xué)多組學(xué)精準(zhǔn)診療應(yīng)用研究會(huì)場(chǎng)
隨著基因組測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展以及生物信息與大數(shù)據(jù)科學(xué)的交互應(yīng)用，精準(zhǔn)診療從理論照進(jìn)了現(xiàn)實(shí)。同時(shí)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)等組學(xué)模式搭載單細(xì)胞和空間測(cè)序技術(shù)的東風(fēng)進(jìn)入單細(xì)胞/空間時(shí)代。人類(lèi)對(duì)腫瘤的分子機(jī)制、疾病的發(fā)生機(jī)理及生命的發(fā)育進(jìn)程等方向能夠進(jìn)行更精細(xì)的解析，并借此實(shí)現(xiàn)在個(gè)體的分子和細(xì)胞而非癥狀水平上制定適合自身的診斷、治療及預(yù)防。本會(huì)場(chǎng)特邀醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)＜引R聚一堂，共同探討醫(yī)學(xué)研究前沿進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)分享。
時(shí)空多組學(xué)技術(shù)發(fā)展及應(yīng)用會(huì)場(chǎng)
大會(huì)培訓(xùn)班
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2022 CBIC第四屆細(xì)胞生物產(chǎn)業(yè)大會(huì)、第二屆中國(guó)生物醫(yī)藥創(chuàng)新合作大會(huì)于2022年7月28-29日在北京隆重舉行。青島百創(chuàng)智能制造技術(shù)有限公司（百創(chuàng)智造）受邀參會(huì)。百創(chuàng)智造劉敏副總裁以“把薪助火 || 百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞、亞細(xì)胞級(jí)分辨率空間轉(zhuǎn)錄組”進(jìn)行了主題演講，分別以單細(xì)胞測(cè)序助力靶藥研究、單細(xì)胞eQTL助力疾病醫(yī)療、時(shí)空組學(xué)指導(dǎo)臨床用藥等視角與眾多參會(huì)代表分享、探討了時(shí)空組學(xué)在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的研究進(jìn)展與未來(lái)展望。
圖1 劉敏副總裁發(fā)表主題演講
圖2 劉敏副總裁和參會(huì)代表分享單細(xì)胞在醫(yī)療領(lǐng)域的研究進(jìn)展
同時(shí)，劉敏副總裁也分享了百創(chuàng)智造助力時(shí)空組學(xué)向臨床醫(yī)療邁進(jìn)的亞細(xì)胞級(jí)空間轉(zhuǎn)錄組芯片-百創(chuàng)S1000和單細(xì)胞微液滴平臺(tái)-百創(chuàng)DG1000。通過(guò)與來(lái)自全國(guó)各地參會(huì)代表的溝通和交流，參會(huì)代表對(duì)我們百創(chuàng)S1000可調(diào)節(jié)的亞細(xì)胞分辨率芯片和百創(chuàng)DG1000極快的單細(xì)胞微液滴系統(tǒng)產(chǎn)生了濃厚的興趣，并希望能夠進(jìn)一步探討和合作。
會(huì)議期間，到訪(fǎng)我們展臺(tái)的代表絡(luò)繹不絕。通過(guò)本次會(huì)議，我們也對(duì)國(guó)內(nèi)細(xì)胞生物研究在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展有了新的理解，對(duì)單細(xì)胞多組學(xué)在臨床應(yīng)用有了更加明確的方向。這些也為我們?nèi)蘸蟮南嚓P(guān)工作提出了指導(dǎo)意見(jiàn)。
圖3 參會(huì)代表了解百創(chuàng)S1000和百創(chuàng)DG1000
百創(chuàng)智造單細(xì)胞平臺(tái)及配套試劑
為了突破單細(xì)胞試劑耗材及儀器長(zhǎng)期以來(lái)的國(guó)外技術(shù)壟斷，降低單細(xì)胞應(yīng)用的成本，讓單細(xì)胞技術(shù)能夠惠及更多的科研群體，經(jīng)過(guò)多年潛心研發(fā)，百創(chuàng)智造發(fā)布自主研發(fā)的極速單細(xì)胞微液滴系統(tǒng)-百創(chuàng)DG1000。百創(chuàng)DG1000是基于微流控、油滴包裹和Barcode標(biāo)記等技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)高通量的細(xì)胞捕獲。除了儀器以外，百創(chuàng)DG1000還有配套的2×4的獨(dú)立芯片及配套試劑盒（圖4）。
圖4百創(chuàng)DG1000
百創(chuàng)DG1000技術(shù)特點(diǎn)：
- 輕巧便攜：背包即走，攜帶方便，便于實(shí)地取樣，應(yīng)用場(chǎng)景更廣；
- 極速：110S即可完成整個(gè)反應(yīng)，減少環(huán)境對(duì)細(xì)胞狀態(tài)的應(yīng)激影響；
- 芯片使用靈活：芯片2*4獨(dú)立設(shè)計(jì)，1~8樣本靈活上機(jī)；
- 兼容更大的細(xì)胞直徑：已成功支持到細(xì)胞直徑60μm。
PBMC重復(fù)性檢測(cè)：將相同的PBMC細(xì)胞懸液分3份，通過(guò)3個(gè)不同實(shí)驗(yàn)人員，用3臺(tái)百創(chuàng)DG1000儀器，獨(dú)立進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序，得到了幾乎一致的細(xì)胞聚類(lèi)分群結(jié)果，證明百創(chuàng)DG1000具有很好的可重復(fù)性及穩(wěn)定性（圖5）。
圖5 PBMC重復(fù)性測(cè)試數(shù)據(jù)
百創(chuàng)智造空間轉(zhuǎn)錄組芯片與配套試劑
為了打破空間測(cè)序市場(chǎng)被國(guó)外公司長(zhǎng)期占據(jù)，以及改變主流商業(yè)化平臺(tái)的分辨率較低的的局面，經(jīng)過(guò)多年的潛心研發(fā)，百創(chuàng)智造發(fā)布了基于微孔微珠的亞細(xì)胞級(jí)分辨率的空間轉(zhuǎn)錄芯片及配套試劑-百創(chuàng)S1000。該技術(shù)直接將空間組學(xué)分辨率從100μm（主流技術(shù)平臺(tái)）提高到~5μm的亞細(xì)胞水平，標(biāo)志著全面邁入國(guó)產(chǎn)化的空間轉(zhuǎn)錄組亞細(xì)胞技術(shù)時(shí)代的到來(lái)（圖6）。
圖6 百創(chuàng)S1000
百創(chuàng)S1000技術(shù)特點(diǎn)：
- 亞細(xì)胞級(jí)分辨率：分辨率可達(dá)到5μm；
- 1~8捕獲區(qū)域：可靈活定制芯片、節(jié)省時(shí)間和實(shí)驗(yàn)成本；
- 支持HE染色：更大程度上還原組織病例形態(tài)；
- 支持多級(jí)分辨率分析：可100μm?~5μm靈活調(diào)整。
大鼠胚胎亞細(xì)胞分辨率實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)展示：與100μm分辨率（主流技術(shù)平臺(tái)）對(duì)比，高分辨率（~50μm）下HE染色組織形態(tài)學(xué)與spots聚類(lèi)空間分布圖重合度更高，精準(zhǔn)識(shí)別空間基因表達(dá)的異質(zhì)性和組織區(qū)域的特異性（圖7）。
圖7：百創(chuàng)S1000胚胎亞細(xì)胞分辨率空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)結(jié)果
掃碼觀(guān)看CBIC北京細(xì)胞生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)大會(huì)報(bào)告視頻回放
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該報(bào)道內(nèi)容于2022年7月17日在北京電視臺(tái)財(cái)經(jīng)頻道《北京直通車(chē)》欄目播出，讓我們一起來(lái)了解百邁客生物如何以科技創(chuàng)新為基石，助力科學(xué)家永攀科研高峰。
圖為北京電視臺(tái)財(cái)經(jīng)頻道編導(dǎo)田聰在發(fā)布會(huì)現(xiàn)場(chǎng)與嘉賓對(duì)話(huà)
近年來(lái)，空間轉(zhuǎn)錄組的研究逐漸受到廣大研究學(xué)者的青睞，這對(duì)于癌癥發(fā)病機(jī)制、神經(jīng)科學(xué)、發(fā)育生物學(xué)等眾多領(lǐng)域的研究都有著重要意義。
中國(guó)科學(xué)院院士陳潤(rùn)生說(shuō)道：“空間轉(zhuǎn)錄組我們知道是整個(gè)多組學(xué)發(fā)展的一個(gè)更前沿的階段。我們從上世紀(jì)90年代開(kāi)始測(cè)序了人的遺傳密碼以后，大家知道對(duì)于整個(gè)生物醫(yī)學(xué)很多基本問(wèn)題的推進(jìn)邁出了劃時(shí)代的一步，就使得這些問(wèn)題的解決到了分子水平。所以這樣看來(lái)，無(wú)論從基礎(chǔ)研究還是對(duì)臨床研究來(lái)講，當(dāng)前的這個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)都是當(dāng)前大數(shù)據(jù)多組學(xué)研究一個(gè)新的進(jìn)展，因此它具有非常重要且深遠(yuǎn)的意義?！?/p>
陳潤(rùn)生院士受北京電視臺(tái)專(zhuān)訪(fǎng)
近日，以精芯智造?探索生命為主題的“亞細(xì)胞級(jí)微孔空間轉(zhuǎn)錄組芯片”發(fā)布會(huì)在京舉辦。百邁客生物經(jīng)過(guò)多年研發(fā)，正式發(fā)布了亞細(xì)胞級(jí)微孔空間轉(zhuǎn)錄組芯片：百創(chuàng)S1000。本次發(fā)布的百創(chuàng)S1000的突破就是將空間分辨率提升至5微米，而傳統(tǒng)的主流空間芯片制造還處于100微米的分辨率。
百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄組芯片
百邁客生物總裁鄭洪坤介紹：我們今天發(fā)布的百創(chuàng)S1000空間組學(xué)的產(chǎn)品，一個(gè)創(chuàng)新點(diǎn)還是解決了之前我們用戶(hù)對(duì)于做這種細(xì)胞水平的基因分析和基因檢測(cè)分辨率太低的問(wèn)題，直接給它做到了一個(gè)亞細(xì)胞的水平。
百邁客生物總裁鄭洪坤受邀專(zhuān)訪(fǎng)中
中國(guó)科學(xué)院院士陳潤(rùn)生表示：今天發(fā)布的百創(chuàng)S1000實(shí)際上大家知道從技術(shù)上應(yīng)該說(shuō)是有很大的提高。百創(chuàng)S1000可以讓研究者們結(jié)合不同階段圖譜數(shù)據(jù)，獲得全面的亞細(xì)胞級(jí)時(shí)空動(dòng)態(tài)表達(dá)圖譜，從而為疾病的診斷治療及藥物研發(fā)提供更有力的決策依據(jù)，相比目前國(guó)外空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序芯片精度提高了近400倍。
百創(chuàng)S1000發(fā)布會(huì)現(xiàn)場(chǎng)
百邁客生物總裁鄭洪坤強(qiáng)調(diào)：我們現(xiàn)在公司三大塊方向，一塊是叫科技服務(wù)是做服務(wù)，一塊是做我們的云平臺(tái)是一個(gè)SaaS（軟件服務(wù)平臺(tái)）的產(chǎn)品，一塊是智能制造。往下走的重點(diǎn)里面會(huì)更多的往智能制造這塊，特別是我們創(chuàng)新的東西會(huì)傾斜的更多一些。
百邁客生物對(duì)于技術(shù)創(chuàng)新的研究仍在繼續(xù)，秉持著生物科技創(chuàng)新服務(wù)社會(huì)、造福人民的企業(yè)使命，企業(yè)將持續(xù)邁進(jìn)、探索生命未來(lái)。
播出視頻如下：
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第九屆全國(guó)功能基因組學(xué)高峰論壇是中國(guó)基因產(chǎn)業(yè)具有影響力的行業(yè)峰會(huì)之一，為展示我國(guó)功能基因組學(xué)在多組學(xué)和大數(shù)據(jù)背景下重大研究進(jìn)展，促進(jìn)功能基因組學(xué)各研究領(lǐng)域的交流與合作，加強(qiáng)行業(yè)信息與資源的共享以及成果轉(zhuǎn)化，在高通量測(cè)序技術(shù)、多組學(xué)分析方法及生物云蓬勃發(fā)展的背景下，本屆大會(huì)將邀請(qǐng)各界領(lǐng)域領(lǐng)軍者共同探索功能基因組學(xué)的新技術(shù)和新思路，以及大數(shù)據(jù)時(shí)代下的功能基因組學(xué)發(fā)展方向與未來(lái)！
會(huì)議基本信息
時(shí)間：2022年10月17日-20日
地點(diǎn)：大會(huì)線(xiàn)上直播間
大會(huì)官網(wǎng)：http://summit.biomarker.com.cn/
主題會(huì)場(chǎng)信息
隨著基因組組裝(GA)、種質(zhì)資源鑒定(GC)、基因功能鑒定(GI)、基因組育種(GB)、基因編輯(GE)的5G育種策略快速發(fā)展，以高通量測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ)的組學(xué)研究已經(jīng)廣泛應(yīng)用于植物研究的各個(gè)領(lǐng)域。本次大會(huì)特邀植物功能基因組學(xué)、系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)、表觀(guān)遺傳學(xué)等熱點(diǎn)領(lǐng)域?qū)＜引R聚一堂，分享植物研究的前沿技術(shù)、經(jīng)驗(yàn)成果及發(fā)展前景。
生物大數(shù)據(jù)是21世紀(jì)具有創(chuàng)新力活躍的技術(shù)領(lǐng)域。完整基因組構(gòu)建、動(dòng)態(tài)三維調(diào)控、功能基因定位、蛋白&代謝等多組學(xué)技術(shù)，在動(dòng)物功能研究上日臻成熟。如何利用大數(shù)據(jù)解析遺傳潛能已成為科研學(xué)者重點(diǎn)研究方向。為了展示和交流動(dòng)物遺傳學(xué)領(lǐng)域的新成果、新進(jìn)展，共同探討動(dòng)物領(lǐng)域的熱點(diǎn)、難點(diǎn)問(wèn)題，本會(huì)場(chǎng)特邀動(dòng)物領(lǐng)域?qū)＜覍W(xué)者，圍繞動(dòng)物起源進(jìn)化及遺傳多樣性、動(dòng)物育種及重要功能性狀遺傳機(jī)制解析等主題，分享研究進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)成果。
微生物組是當(dāng)今世界熱門(mén)的研究領(lǐng)域之一，新發(fā)現(xiàn)，新技術(shù)層出不窮，高通量測(cè)序作為微生物組研究的有力工具，在植物-微生物-相互作用，病原微生物與健康，傳染病診斷與防治、微生物生理代謝與合成生物學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用。本會(huì)場(chǎng)特邀微生物領(lǐng)域?qū)＜引R聚一堂，共同探討微生物研究前沿進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)分享。
疾病的發(fā)生發(fā)展涉及基因變異、基因表達(dá)失調(diào)、表觀(guān)遺傳改變、代謝蛋白分子變化等復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，搭載Nanopore測(cè)序技術(shù)，聯(lián)合基因表達(dá)量、染色質(zhì)三維構(gòu)象、染色質(zhì)可及性、代謝物和蛋白質(zhì)多肽等熱點(diǎn)研究方向，可以從多組學(xué)維度系統(tǒng)性研究發(fā)病機(jī)理、確認(rèn)疾病靶點(diǎn)和發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物。本會(huì)場(chǎng)特邀醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)＜引R聚一堂，共同探討醫(yī)學(xué)研究前沿進(jìn)展及經(jīng)驗(yàn)分享。
隨著單細(xì)胞和空間多組學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展，開(kāi)啟生命科學(xué)時(shí)空多維新時(shí)代，為復(fù)雜疾病的細(xì)胞異質(zhì)性和結(jié)構(gòu)異質(zhì)性研究提供新視角，百邁客自主研發(fā)的百創(chuàng)DG1000單細(xì)胞、百創(chuàng)S1000空間測(cè)序技術(shù)不僅開(kāi)啟了空間轉(zhuǎn)錄組亞細(xì)胞時(shí)代，還極大的降低單細(xì)胞&空間組學(xué)科學(xué)應(yīng)用的成本和門(mén)檻，同時(shí)促進(jìn)了單細(xì)胞空間組學(xué)在生長(zhǎng)發(fā)育、疾病機(jī)理、免疫調(diào)控、腫瘤精準(zhǔn)研究等方向的廣泛應(yīng)用。本次論壇特邀請(qǐng)單細(xì)胞、空間轉(zhuǎn)錄組的科學(xué)家和業(yè)界技術(shù)專(zhuān)家齊聚一堂，共同分享該領(lǐng)域的進(jìn)展和未來(lái)愿景。
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5月份，北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院聯(lián)合百邁客生物針對(duì)農(nóng)作物應(yīng)用研究方面的前沿技術(shù)開(kāi)展了學(xué)術(shù)交流。
會(huì)上百邁客生物一行針對(duì)近期推出的亞細(xì)胞級(jí)微孔芯片百創(chuàng)S1000，以及國(guó)產(chǎn)化單細(xì)胞儀器百創(chuàng)DG1000與研究院PI們進(jìn)行了熱烈的討論，話(huà)題主要集中在如何將新的技術(shù)能更好的應(yīng)用到產(chǎn)品研究中，從而提高農(nóng)業(yè)作物的成果轉(zhuǎn)化。同時(shí)，北京大學(xué)鄧興旺院士及百邁客生物董事長(zhǎng)鄭洪坤也表示，雙方要加強(qiáng)對(duì)外交流，利用雙方的優(yōu)勢(shì)來(lái)進(jìn)一步開(kāi)拓大家的科研視野，提升青年科研工作者的科研激情，從而帶領(lǐng)大家一起為國(guó)家的“糧食”做好“后勤工作”。
據(jù)悉，北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院是北京大學(xué)與山東省人民政府合作共建。2021年7月研究院正式搬入山東濰坊新院區(qū)，新院區(qū)坐落于美麗的峽山風(fēng)景區(qū)旁，占地300畝，目前已建成科研綜合樓、接待中心、會(huì)議中心、餐飲中心、高級(jí)專(zhuān)家公寓、教師公寓、學(xué)生公寓等7.1萬(wàn)平米的房屋設(shè)施。
研究院致力于從事基礎(chǔ)研究-應(yīng)用研究-成果轉(zhuǎn)化-產(chǎn)業(yè)扶持的全鏈?zhǔn)浆F(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工作。?配備冷凍透射電鏡、全套質(zhì)譜分析系統(tǒng)等價(jià)值2億多元設(shè)備及241名高精尖專(zhuān)家學(xué)者，?以小麥雜交育種技術(shù)為突破口，解決世界第一大主糧的“芯片”問(wèn)題，為國(guó)家的糧食安全提供技術(shù)保障。同時(shí)，以滿(mǎn)足人民美好健康生活為目標(biāo)，聚焦農(nóng)業(yè)新業(yè)態(tài)，培育果蔬新品種，解決我國(guó)蔬果種子攻堅(jiān)戰(zhàn)中的卡脖子問(wèn)題。配合“三個(gè)模式”的戰(zhàn)略發(fā)展定位，探索農(nóng)業(yè)科技與鄉(xiāng)村振興互促共生的新模式、新路徑，為濰坊乃至山東及全國(guó)的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)高質(zhì)量發(fā)展提供智庫(kù)支撐。
未來(lái)，北京大學(xué)現(xiàn)代研究院與百邁客將會(huì)加深雙方人才及技術(shù)的交流，利用雙方高新技術(shù)及高精尖專(zhuān)業(yè)人才，共同推進(jìn)中國(guó)農(nóng)業(yè)科技的發(fā)展，助力中國(guó)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)高質(zhì)量發(fā)展。
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